Действие фантастического боевика "Глубокое синее море" разворачивается в лаборатории под названием "Акватика". Она располагается под водой. Учёные трудятся под руководством мудрой и целеустремленной красавицы Сьюзен. Ей удаётся создать уникальный препарат, способный излечить пациентов, страдающих от болезни Альцгеймера. Ребята ставили опыты над морскими обитателями. Они добывали мозговые клетки акул и использовали их для разработки необходимого медикамента. Вещества крайне недостаточно для того, чтобы продолжать гениальные исследования. По этой причине женщина отваживается провернуть небольшую авантюру. Она объединяется с доктором Уитлоком и начинает пользоваться методами генной инженерии.
После смелого эксперимента хищники превращаются в теряющих контроль особей. Они становятся убийцами и охотятся на граждан. Существа мутируют и оказываются обладателями интеллекта. Люди не могут перехитрить умных монстров и избежать опасности. Количество жертв множится с устрашающей силой. Члены команды не в состоянии понять, как следует действовать в экстренной ситуации. Они предпринимают попытки оценить ущерб потерь и спасти собственные жизни. Тем временем положение лишь усугубляется. Чудовища намереваются отомстить исследователям за издевательства над ними.
