Сюжет рассказывает историю школьника, который изучает множество философских вопросов, увлекается чтением и анализом религиозных суждений. Последнее затягивает его в большей степени, и постепенно герой становится самым настоящим религиозным фанатиком.
Фильм Ученик - это история о том, как молодой ум может стать жертвой собственных размышлений, что сподвигнет его впоследствии, к неблагоприятным последствиям. После того, как он успевает расширить свои знания относительно интересующей его темы, он желает поделиться с ними со всем своим окружением. Именно так, он начинает воздействовать на головы товарищей и становится заметным объектом учебного заведения. Несмотря на это, многие не замечают, насколько детально парень углубился в изучение мира, найти ответы в котором, практически невозможно. Лишь учительница биологии подмечает, как внимательно относится ее ученик к столь серьезной теме. Женщина - атеистка уверена, что подобные увлечения не сулят ничего хорошего и решает посодействовать в том, чтобы уберечь ребенка от необдуманных выводов. Удастся ли ей оказать помощь потерянному ученику и не спровоцировать в нем агрессивное расположение в свою сторону?