Мелкого клерка крупной японской компании Окадзиму Рокура (Рока) отправляют в командировку. Его задача - привезти диск с секретной информацией. В пути происходит непредвиденное: в Южно-Китайском море корабль, на котором плыл Рок, захватывают пираты, нанятые русской мафией "Отель Москва".
Рока берут в заложники с целью получить выкуп. Однако руководство фирмы решает уничтожить и диск, и клерка. Чудом выжив, Окадзима настолько разочаровался в людях, что решил остаться с пиратами. Так он попадает на катер "Черная лагуна", принадлежащий компании по доставке грузов.
Офис "Лагуны" находится в вымышленном городе Роанапуре. Это пристанище представителей мафиозных структур. Року нравится жизнь вне закона, о своем прошлом он и не вспоминает, но даже находясь среди бандитов, старается сохранять человеческое лицо.
С ним порой конфликтует, а временами и оказывает ему помощь китаянка Реви. Безжалостная, бескомпромиссная девчонка ценит только деньги, великолепно стреляет из пистолетов "Беретта" двумя руками и надеется исключительно на себя. В каждой серии Рок, Реви и другие члены команды под руководством бывшего морпеха Датча выполняют поручения мафиози, попадая в сложные ситуации и виртуозно выпутываясь из них.
В сериале много цитат из популярных приключенческих фильмов, а также повторений сцен из них. Замечательные саундтреки начинают и заканчивают каждую серию. Море адреналина, стрельба, погони понравятся любителям боевиков. Сериал по праву считается одним из лучших аниме-боевиков.
