Действие зарубежной исторической драмы "Молчание" происходит в 17-ом столетии. На дворе 1640-й год. Глава церкви разговаривает с двумя иезуитами, приехавшими из далёкой Португалии. Темой беседы является их старый знакомый Феррейра, который некоторое время назад покинул родные края и отправился искать смысл жизни. По последним сведениям он обосновался в стране восходящего солнца, где отказался от веры и женился на женщине японского происхождения. Священнослужители не в состоянии поверить в подобное положение вещей и направляются в Японию с целью установить истину. Он был их духовным наставником, поэтому ребята искренне благодарны ему за полученные знания и своевременные наставления.
Путешествие молодых людей начинается с местной деревушки, на территории которой ваются тайные христиане. Они вынуждены молиться по ночам, поскольку днём есть огромный риск быть пойманным. В сельскую местность также прибывает беспощадный инквизитор. Иноуэ требует у пленников доказать свою причастность к буддизму. В противном случае несчастных узников ожидает немедленная смерть. Лишь один из четверых был отпущен на свободу, остальных безжалостно казнили. Отцы Гарупе и Родригес понимают, что беззащитное население обязано подчиняться суровым законам и пытаются бороться за восстановление справедливости любой ценой.