В маленьком провинциальном городке фильма «Яга: Кошмар темного леса» странным образом пропадают дети. Местные службы безопасности бессильны никаких улик и следов на месте преступления не обнаружено. Полицейские прилагают все усилия, чтобы пой маньяка, но их поиски не приносят результата. Здешние обитатели находятся в жутком напряжении, боясь за своих детей, а в воздухе висит зловещая атмосфера страха и ужаса. Создается впечатление, что город находится в опасности и в этом предстоит разобраться главным героям. Им предстоит столкнуться со страхами, связанными с детскими сказками, а всему виной окажется страшная Баба-Яга, злобная и жестокая женщина.
Каждый родитель, нанимая няню для своего чада сталкивался с сомнениями и чувствами беспокойства, о надежности нового члена семьи, присматривающим за самым сокровенным. Даже пушистая и безобидная девушка, скрывает в себе потаенные мысли. Стоит ошибиться и жизнь идет вверх дном, поначалу малыш становится беспокойным, нервным. Он не рад новой гостье и не желает оставаться на едине с незнакомкой. Но мамы списывают все на случайность и отбрасывая внутреннюю тревогу, спокойно идут на работу, полностью доверяя нянечке, даже не предполагая, что сказка станет явью. Самые жуткие детские фантазии воплотятся в реальных чудовищ и ведьм.
Так еще в одной семье случается несчастье — няня похищает ребенка. Лишь в ходе расследования, постепенно становится понятно, что она воплощение главного монстра русской мифологии, ведьма, живущая на границе мира мертвых и живых. Своим происхождением она обязана вековым легендам, но скоро станет понятна иная картина появление похитителя-убийцы. Главный следователь уверен, что близок к разгадке чудовищных преступлений, и теперь герою придется оказаться в центре ожесточенной битвы паранормальных явлений.