Главным действующим лицом анимационного фильма "Тайная жизнь пингвинов" становится обаятельный подросток по имени Аояма, который обладает добрым нравом и обожает совершать невообразимые открытия. Он учится в 4-ом классе и получает неплохие отметки. Но более всего симпатичный мальчишка любит познавать окружающий мир. У него имеется дневник, на страницы которого он спешит записать все, что случается с ним за день. Ни одно интересное событие ни при каких условиях не ускользнет от цепкого взгляда маленького авантюриста. Оптимистически настроенный японец проводит неоднозначные эксперименты и добивается впечатляющих результатов.
Ключевой персонаж проживает вместе со своей родней в живописном городке, расположенном возле морского побережья. Благоприятный климат позволяет ему часто бывать на свежем воздухе. Во время очередной прогулки любознательный юноша наталкивается на милых пингвинчиков. После неожиданной встречи несовершеннолетний герой находит странную сферу. Он заинтересовывается таинственным объектов и ставит перед собой глобальную цель. Сообразительный паренек планирует выяснить, в чем заключается предназначение загадочного феномена.
